Ήταν λογικό και αναμενόμενο ότι το Fallout 4 θα προσέλκυε τους modders όπως το μέλι τις μέλισσες, οι οποίοι σχεδόν από την day 1 που κυκλοφόρησε το γνωστό post-apocalyptic RPG στρώθηκαν στη δουλειά για να αναπτύξουν τα δικά τους mods. Ορισμένα από τα mods που έχουν ήδη κυκλοφορήσει για το Fallout 4 δεν επεμβαίνουν σε μεγάλο βαθμό στα αρχεία του παιχνιδιού, ωστόσο υπάρχουν κι άλλα mods που ακολουθούν τον ακριβώς αντίθετο δρόμο, καθώς έχουν άμεση σχέση με την ενεργοποίηση και τη χρήση εντολών στην debugging console του τίτλου (θέτοντας σε λειτουργία ορισμένα από τα cheats του παιχνιδιού).
Αυτό πρακτικά σημαίνει ότι οι users μπορούν να επέμβουν και να «πειράξουν» ζωτικής σημασίας στοιχεία του Fallout 4, όπως για παράδειγμα είναι η συμπεριφορά των NPCs, η δομή των quests και τα αντικείμενα στο inventory κ.α. H debugging console είναι ενεργή μόνο στην PC version του παιχνιδιού, με το στέλεχος της Bethesda Pete Hines, να δηλώνει χαρακτηριστικά ότι η δυνατότητα για εισαγωγή εντολών και η χρήση cheats δεν θα ισχύσει στην περίπτωση του PS4 και του Xbox One. Μάλιστα, ο Pete Hines αλλά και η Bethesda αποθαρρύνουν τους gamers από το να «πειράζουν» την κονσόλα του παιχνιδιού, καθώς σύμφωνα με το development team του Fallout 4 η χρήση των console commands ενδεχομένως να χαλάσει ορισμένα από τα αρχεία του παιχνιδιού και ειδικότερα τα save games. Για αυτό λοιπόν, εάν θέλετε να πειραματιστείτε με το Fallout 4 οφείλετε να γνωρίζετε ότι μπορεί και να χαλάσετε το save game system του παιχνιδιού.
